O financiamento de cada uma das plataformas do NPOP-PBIS foi concedido por um período de dois anos; a renovação, por decisão da Fapesp, pode acontecer até um máximo não prorrogável de cinco anos. Os projetos de pesquisa apresentados em cada uma das plataformas devem considerar o orçamento total necessário para sua operação, assim como das fontes, incluindo a Fapesp e seus parceiros, que contribuirão para cada item.
Toda a contrapartida institucional foi descrita e quantificada em dados físicos e valores financeiros e econômicos: dotação, salários de pesquisadores e pessoal de apoio, instalações (planta da área a ser ocupada pela plataforma), equipamentos e infraestrutura a que o Núcleo terá acesso (comunicação, rede computacional, oficinas de apoio, recursos administrativos), etc.
Da mesma maneira, são esperados esforços continuados para mobilizar recursos de outras fontes durante o processo de realização das pesquisas. Assim, na avaliação de dois anos, as lideranças do Núcleo deverão demonstrar a mobilização de recursos extra Fapesp e extra parceiros iniciais.
O valor oferecido pela Fapesp para o NPOP-PBIS é de R$ 3,3 milhões e deverá ser aplicado ao longo de cinco anos.